Intérêts de l’analyse des groupes de synténie bactérienne. Des similarités significatives (ou parentés) entre gènes, au sein d’une même espèce ou entre plusieurs espèces, vont permettent d’inférer certaines propriétés aux protéines codées. Ainsi, la comparaison du génome III aux génomes I et II révèle que le premier ensemble constitué de cinq gènes contigus contient 4 gènes dont les orthologues ont une même organisation locale dans le génome II, et une organisation proche dans le génome I. On peut envisager que cet ensemble de gènes représente une famille de gènes universelle et que le gène situé au centre de cette famille (en blanc) a probablement une fonction proche du gène rouge situé au même endroit dans le génome II. Ce type d’analyse permet aussi d’identifier des mécanismes évolutifs résultant de la fusion/fission de gènes ainsi que des opérons conservés entre différentes espèces.