Comparaison de séquence de la LEI avec des enzymes ayant des homologies structurales ou de fonction. A. séquence complète de la LEI de cheval alignée avec celles de deux autres LEI de mammifère (humaine et porcine). Quelques séquences sont ou peuvent être déterminantes pour le fonctionnement de cette serpine : en rouge le signal d’importation nucléaire, en bleu turquoise des résidus présumés du site actif, en rose une séquence candidate pour la fixation de la thymosine, en vert la région charnière de la boucle réactive, en bleu foncé les résidus P1 et P’1 encadrant le site de coupure par la protéase cible (flèche), en italiques le segment C-terminal en aval du site de coupure. La boucle réactive est soulignée. B. Séquences C-terminales de quelques DNases. On retrouve dans chacune d’elles la séquence DH (acide aspartique, histidine), qui n’est pas retrouvée dans le reste de la molécule. 1 : CAD (caspase activated DNase) humaine ; 2 : DNase II humaine ; 3 : DNase γ humaine ; 4: LEI de cheval ; 5: LEI humaine ; 6: AP endonucléase humaine ; 7 : DNase I humaine. Le couple DH est considéré comme essentiel pour l’activité de certaines DNases. C. Signaux d’importation nucléaire. a. Signaux classiques d’importation nucléaire. Deux types de signaux peuvent être identifiés sur la structure primaire d’une protéine nucléaire : (1) les signaux monopartites, sur le modèle de celui porté par l’antigène T du virus SV40, composés de 3 à 5 résidus basiques (lysine ou arginine) successifs ; (2) les signaux bipartites, sur le modèle de celui porté par la nucléoplasmi-ne, composés de 2 séquences de 2 et 3/4 résidus basiques respectivement, séparées par une dizaine de résidus quelconques. b. La LEI possède un signal bipartite classique. Celui-ci n’est pas retrouvé dans les séquences des autres serpines analysées, mais un signal monopartite est retrouvé sur la bomapine et un signal bipartite atypique est retrouvé sur l’antichymotrypsine, dont l’adressage nucléaire a été démontré. La séquence “signature” des serpines est repérée en italiques (oc-1-PI : (X-1-proteinase inhibitor).