Le Collaborative Cross

Un outil révolutionnaire à l’assaut des caractères complexes

The Collaborative Cross, a groundbreaking tool to tackle complex traits

Génétique fonctionnelle de la souris, URA CNRS 2578, Institut Pasteur, 25, rue du Docteur Roux, 75015 Paris, France

^* panthier@pasteur.fr
^** xmonta@pasteur.fr

Résumé

Les caractères complexes, comme la vulnérabilité des personnes à une maladie commune, sont contrôlés par des régions génomiques nombreuses dont les effets phénotypiques sont généralement faibles. Partant de ce constat, des généticiens ont développé un nouveau système expérimental pour disséquer la génétique des caractères ­complexes chez la souris. Le Collaborative Cross est une population génétique de référence comprenant plus de 300 lignées consanguines issues de huit lignées appartenant à trois sous-espèces de Mus musculus et ayant capturé 90 % du polymorphisme connu chez la souris. Nous décrivons ici la fabrication et les propriétés du Collaborative Cross et rapportons les résultats des premières expériences ­effectuées sur des lignées en cours d’obtention.

Abstract

Complex traits, like the susceptibility to common diseases, are controlled by numerous genomic regions which individual effect is generally weak. These observations led geneticists to develop an experimental system to dissect the genetic of complex traits in the mouse. The Collaborative Cross (CC) is a genetic reference population of over 300 inbred lines derived from eight inbred strains of three Mus musculus sub-species that captures 90% of the genetic variation known in the mouse genome. We present here the generation and the characteristics of the CC and we report the results of the first experiments with partially inbred CC lines.