Prédire la transcription à partir des séquences génomique

Prediction of transcription and genomic sequences

Laboratoire de Génétique et dephysiologie du développement,LGPD-IBDM, CNRS, Case 907Université de la Méditerranée,Campus Scientifique de Luminy,13288 Marseille Cedex 9, France

^* thieffry@ibdm.univ-mrs.fr

Résumé

Les développements technologiques récentsont grandement facilité et accéléré l’obtentiondes séquences nucléiques à l’échelle génomique.À partir de ces séquences, les bio-informaticienstentent de délimiter les régions fonctionnelles,y compris bien sûr les gènes, maisaussi les motifs et les conditions qui contrôlentleur expression. Dans un article récemmentpublié dans Cell, M.A. Beer et S. Tavazoie combinentune méthode de classification (clustering)de données de transcriptome (puces àADN), un logiciel de découverte de motifs cisrégulateurs,ainsi qu’une méthode d’apprentissageprobabiliste pour inférer des règles susceptiblesde rendre compte des profils d’expressiontranscriptionnelle observés.