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Les antibiotiques provoquent une dysbiose intestinale qui altère l’immunité pulmonaire et favorise les surinfections bactériennes. 1. Trois groupes de souris sont infectés par voie intranasale par le virus de la grippe A (PR8), puis surinfectés par Staphylococcus aureus résistant à la méticilline (SARM). 2. Un traitement antibiotique est administré pendant 14 jours à un des groupes (), tandis qu’aucun traitement n’est administré pour le groupe témoin (). 3. Les souris ayant reçu le traitement antibiotique développent une dysbiose intestinale avec prolifération fongique (Malassezia, Saccharomyces), absente chez les témoins dont le microbiote reste équilibré. 4. Le traitement antibtiotique est associé à une réponse immunitaire pulmonaire altérée : augmentation de la concentration d’interféron gamma (IFN-γ), infiltration massive d’éosinophiles sécrétant la Major Basic Protein-1 (MBP-1), inhibition des macrophages et augmentation de la charge bactérienne pulmonaire. À l’inverse, les souris témoins présentent des taux stables d’éosinophiles et une clairance efficace du SARM. 5. Un co-traitement antibiotique et antifongique a été administré à un autre groupe (). Les souris présentent une réduction de l’inflammation, une infiltration modérée d’éosinophiles, une restauration de la fonction macrophagique, et une clairance bactérienne améliorée, proche du profil observé chez les souris témoins.

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