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Figure 2

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Analyse du polymorphisme nucléotidique des isolats de E. coli-BLSE des trois « secteurs » (Homme, animal, environnement) à Antananarivo (Madagascar). A. Diagramme de Fruchterman-Reingold représentant la dissémination et intrasectorielle et intersectorielle d’isolats différant par moins de 40 single nucleotide polymorphisms (SNP). La longueur des branches n’est pas représentative du nombre de SNP. B. Diagramme de Sankey représentant les liens entre secteurs (à gauche), isolats de E. coli-BLSE (au milieu), et plasmides porteurs de gènes BLSE définis par leur sous-type (à droite). Les rectangles colorés de la colonne centrale représentent les différents clones de E. coli-BLSE, définis comme des isolats de même « séquence type » (ST), sérotype, et allèle fimH.

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