Arbre phylogénétique des isolats de Escherichia coli producteurs de β-lactamase à spectre étendu (E. coli-BLSE) des trois « secteurs » (Homme, animal, environnement) à Antananarivo (Madagascar). L’arbre a été enraciné sur Escherichia fergusonii. Les isolats et leurs branches terminales sont colorés en fonction de leur groupe phylogénétique. L’anneau intérieur représente l’origine de l’isolat (femme enceinte, poulet, environnement). Le deuxième anneau indique le « séquence type » (ST) de chaque isolat. Le troisième anneau représente le variant CTX-M. L’anneau extérieur représente l’emplacement (plasmide ou chromosome) des gènes bla_CTX-M. L’échelle se réfère à la longueur des branches, qui correspond au nombre de substitutions nucléotidiques par site.