Tableau I.
Les différentes séquences répétées dans le génome humain. Les séquences répétées peuvent être classées en deux catégories: les répétitions en tandem et les répétitions dispersées. Ce Tableau reprend les différentes répétitions retrouvées chez l’homme et la fraction du génome qu’elles représentent (adapté de [1,52–55]). *Les microsatellites peuvent être classés dans les deux catégories puisqu’il s’agit de répétitions en tandem présentes à de multiples endroits dans le génome.
| Répétitions en tandem | |||||
| Longueur d’une unité | Longueur de la région (environ) | % du génome | |||
| Télomères | 6 pb | 10-15 kb | 0,01 | ||
| Paralogues en tandem | rDNA | 45 kb | 50 kb-6 Mb | 0,32 | |
| Duplications segmentales | 1-400 kb | 1 kb-5 Mb | 6,60 | ||
| Microsatellites (STR)* | 2-6 pb | 10-100 pb | 3,20 | ||
| Minisatellites (VNTR) | 10-100 pb | 100 pb-20 kb | |||
| Satellites (centromères et péricentromères) | Satellite alpha | 171 pb | 0,2-8 Mb | 6,20 | |
| Satellite beta | 68 pb | 0,2 kb-2 Mb | |||
| Satellite gamma | 220 pb | 11-121 kb | |||
| Satellite humain 1 | 42 pb | 0,2 kb – 5 Mb | |||
| Satellite humain 2 | Variable | 1 kb – 13 Mb | |||
| Satellite humain 3 | Variable | 1 kb – 28 Mb | |||
| Satellite humain 4 | 35 pb | 0,7-48 kb | |||
| Satellite humain 5 | 14-15 pb | 0,5-6 kb | |||
| Macrosatellites | 100 pb-5 kb | 300 kb | 0,10 | ||
| Mégasatellites | 1-5 kb | 400 kb | |||
| Répétitions dispersées |
|||||
| Nombre de copies | % du génome | ||||
| Rétrotransposons | Non-LTR | LINE | LINE-1 | 560 799 | 16,77 |
| LINE-2 | 372 147 | 3,41 | |||
| autres | 66 306 | 0,50 | |||
| SINE | Alu | 1 148 496 | 10,09 | ||
| MIR | 539 657 | 2,65 | |||
| autres | 8 822 | 0,03 | |||
| SVA | 6 632 | 0,15 | |||
| LTR | HERV | Classe I | 124 575 | 2,73 | |
| Classe II | 8 570 | 0,28 | |||
| Classe III | 120 330 | 1,93 | |||
| MaLR | 258 048 | 3,63 | |||
| Gypsy | 18 542 | 0,16 | |||
| autres | 12 402 | 0,10 | |||
| Transposons ADN | hAT | 313 620 | 2,08 | ||
| Tc-1/Mariner | 129 286 | 1,40 | |||
| autres | 14 371 | 0,02 | |||
| Microsatellites (STR)* | 1 600 000 | 3,00 | |||
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