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Tableau I.

Les avantages et les inconvénients du système CRISPR/Cas9, du Base editing et du Prime editing.1 Possibilité de déterminer la finalité de l’édition.

CRISPR/Cas9 Base editing Prime editing
Mutations hors cibles significatives Peu ou pas de mutations hors-cibles Peu ou pas de mutations hors-cibles

Mutations hors cible (off-targets)
  • Possibilité d’indel (insertions, délétions) non spécifiques au niveau du site de coupure double brin [34] ;

  • Le plasmide donneur peut s’intégrer dans le génome ;

  • Possibilité de mutations hors cibles à l’échelle du génome.

  • Pas de coupures doubles brins ;

  • Modifications possibles d’autres bases dans une fenêtre étroite de 4 à 10 nucléotides [35] ;

  • Des études sur les mutations hors cibles à l’échelle du génome doivent être réalisées.

  • Pas de coupures doubles brins ;

  • Pas de modifications obligatoires d’autres bases dans la fenêtre ciblée ;

  • Des études sur les mutations hors cibles à l’échelle du génome doivent être réalisées.


Flexibilité
  • Peut introduire des insertions, des délétions et tous les types de substitutions.

  • Peut introduire des substitutions : C > T, G > A, A > G, T > C et C > G uniquement ;

  • La prise en compte des modifications supplémentaires dans la fenêtre ciblée rend le Base editing plus stricte sur les sites possibles [35].

  • Peut introduire des insertions, des délétions et tous les types de substitutions ;

  • Exigences moins strictes en matière de PAM (protospacer adjacent motif) [36].


Programmabilité1 Uniquement si un plasmide donneur d’ADN est fourni. Oui Oui

Distribution in vivo Actuellement possible. Actuellement possible. (mais plus difficile qu’avec CRISPR/ Cas9 en raison de sa taille plus importante) Nécessité d’améliorations. (trop grand pour les vecteurs de transfert de gène conventionnels)

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