L’accumulation de polymorphismes dans les génomes peut affecter le taux de mutation local dans une fraction non négligeable du génome et conduire au recrutement de différentes mutations face à une nouvelle pression sélective. Nous montrons ici la généalogie de trois séquences dans lesquelles des mutations neutres (diamants colorés) se sont accumulées. Les séquences résultantes diffèrent par leur taux de mutation local, comme le montre la hauteur des histogrammes, qui sont colorés en fonction de la couleur de la mutation entraînant les changements du taux de mutation local. Lorsqu’un changement environnemental est appliqué indépendamment à ces différents clones, ces changements de taux locaux peuvent conduire à la sélection de différentes mutations bénéfiques illustrées par des triangles rouges et entraîner une différenciation supplémentaire du génome.