Altérations microbiennes chez les patients atteints du syndrome de l’intestin irritable diarrhéique et profil métabolique associé. Le microbiote colique des patients atteints du syndrome de l’intestin irritable diarrhéique (SII-D) est caractérisé par une perte de diversité microbienne associée à une diminution globale des Firmicutes, plus précisément des Lachnospiraceae, Gammaproteobacteria, Enterobacteriaceae et de l’espèce Escherichia coli. L’espèce Faecalibacterium prausnitzii est cependant généralement surreprésentée chez les patients atteints de SII-D, comparativement aux sujets sains. Les Bacteroidetes sont globalement augmentés (surtout les genres Clostridium, Streptococcus et Bifidobacterium). Les bactéries intervenant directement dans le métabolisme des nutriments, le profil métabolique des patients est également altéré, se caractérisant par une augmentation des acides gras à chaîne courte, plus précisément de l’acétate et du butyrate, associée à une baisse du pH colique. Le ratio acides biliaires primaires/acides biliaires secondaires est augmenté, dû en partie à une malabsorption des acides biliaires chez 30 % des patients. AB I : acide biliaire primaire ; AB II : acide biliaire secondaire ; AGCC : acide gras à chaîne courte ; MAB : malabsorption.