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Tableau I.
Techniques permettant l’étude de la méthylation de l’ADN.
| Abréviation | Méthode | Fonctionnement |
|---|---|---|
| BS et WGBS | Séquençage bisulfite (Bisulfite Sequencing et Whole Genome Bisulfite Sequencing) | Le traitement au bisulfite de sodium entraîne la désamination des cytosines non méthylées, les transformant en uraciles, tandis que les 5mC demeurent intactes. Le profil et le taux de méthylation peuvent ainsi être déterminés en comparant les séquences d’ADN traitées ou non. |
| ELISA | Dosage d’immunoabsorption par enzymes liées (Enzyme-Linked Immunosorbent Assay) | Utilisation d’anticorps dirigés contre les 5mC pour quantifier les taux de méthylation. |
| IF | Immunofluorescence | Utilisation d’anticorps dirigés contre les 5mC, pour visualiser l’ADN méthylé en microscopie de fluorescence. |
| MeDIP | Immuno-précipitation d’ADN méthylé (Methylated DNA ImmunoPrecipitation) | Utilisation d’anticorps dirigés contre les 5mC pour immunoprécipiter les séquences d’ADN méthylées. Permet de dresser le profil de méthylation. |
| MS | Spectrométrie de masse (Mass Spectrometry) | Tri de séquences d’ADN base-spécifique, permet de différencier les 5mC des cytosines non-méthylés en raison de leur masse différente, permet de quantifier le taux de méthylation. |
| MSRE | Enzymes de restriction sensibles aux sites de méthylation (Methylation-Sensitive Restriction Enzymes) | Utilisation d’enzymes de restriction sensibles à la méthylation de leurs séquences cibles, suivie de la détection des fragments obtenus. |
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