Tableau I.
Liste des techniques, ressources et outils pour la culture et la génomique fonctionnelle de Nematostella vectensis.
| Culture et expérimentation | |
|---|---|
| Culture et ponte | [6, 21, 44] |
| Induction et suivi de la régénération | [17, 38, 39] |
| Microinjection et micromanipulation | [58, 59, 60] |
| Génome, ressources et protocoles pour analyses omiques | |
| Génome annoté | [18, 61] https://mycocosm.jgi.doe.gov/Nemve1/Nemve1.home.html https://simrbase.stowers.org/starletseaanemone |
| Puces à ADN | [58] |
| RNA-seq/transcriptome | [20, 40, 64]http://nvertx.kahikai.org |
| scRNA-seq | [12] |
| ATAC-seq | [12] |
| ChIP-seq | [19] |
| Analyse de l’expression spatio-temporelle | |
| ARNm in situ | [21, 41] |
| Immunohistochimie | [43, 60] |
| Rapporteurs transgéniques | [22, 63] |
| Outils pour étudier la fonction génique | |
| Surexpression d’ARNm | [58, 59, 60] |
| Morpholinos* | [58, 59, 62] |
| TALEN/Fok1, CRISPR/Cas9 | [22] |
| Promoteurs inductibles | [22] |
*Morpholino : molécule synthétique antisens d’environ 25 bases qui se fixe aux séquences complémentaires d’ARN par appariement de bases. Il peut être utilisé pour bloquer la traduction ou modifier l’épissage du préARNm et ainsi diminuer l’expression d’un gène.
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