Figure 6.

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Recherche de similarités entre les séquences codant pour la protéine spike de CoV2 et le génome de HIV. A. Alignement le plus significatif entre la séquence codant pour la protéine S de SARS-CoV-2 (query) et le génome du VIH (subject). B. Contrôle négatif : alignement le plus significatif entre une séquence aléatoire, obtenue en mélangeant les nucléotides de la séquence précédente, et le génome du VIH. Noter la valeur du score expect, qui indique le nombre de faux-positifs attendus au hasard. Ce score présente pour les deux alignements des valeurs supérieures à 1, et est même plus élevé pour l’alignement de la séquence de CoV que pour la séquence aléatoire. On peut en conclure que la similarité entre la séquence codante de la protéine S et le génome du VIH n’est pas significative. Les alignements ont été réalisés sur le site BLAST du NCBI (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi).
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