Le taux d’identité entre SARS-CoV-2 et les autres coronavirus varie selon la position dans le génome. Le niveau 100 % correspond au génome de référence du SARS-CoV-2. A. Pourcentage d’identité entre SARS-CoV-2 et d’autres coronavirus le long du génome entier (fenêtres glissantes de 800 nucléotides). B. Pourcentage d’identité le long du gène S (fenêtres glissantes de 200 nucléotides). C-E. Impact des recombinaisons sur la topologie des arbres phylogénétiques inférés à partir de différentes régions génomiques: gène ORF1ab (C) , région codante de la partie S1 de la protéine S (D) , et RBD (E) .