Organisation du génome du HEV. Le HEV possède un génome à ARN simple brin de polarité positive d’environ 7 200 nucléotides avec respectivement à ses extrémités 5’ et 3’ une coiffe (m⁷G.Cap) et une queue poly(A). Il présente trois cadres ouverts de lecture (ORF) encadrés par deux régions non codantes (NCR). Ces ORF codent respectivement trois protéines appelées ORF1, ORF2 et ORF3. La protéine ORF1 est une polyprotéine traduite à partir de l’ARN génomique qui est importante pour la réplication virale. Elle possède sept domaines : le domaine méthyl-transférase (Met) ; le domaine Y ; le domaine papaïne cystéine protéase (PCP) ; le domaine hypervariable (HVR) ; le macrodomaine X ; le domaine hélicase (Hel) et le domaine ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp). Les protéines ORF2 et ORF3 sont synthétisées à partir d’un ARN sous-génomique bicistronique de 2,2 kb (ARNmSG). L’ORF2 est la protéine de capside virale. La protéine ORF3 joue un rôle important dans la sécrétion des particules virales. N : extrémité amino-terminale ; C : extrémité carboxy-terminale ; m⁷G.Cap : coiffe ; A(n) : queue poly(A).