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Tableau I.
Principales études montrant la colonisation du milieu in utero. * : PCR en temps réel ciblant des espèces habituellement retrouvées au niveau du microbiote vaginal. + : Prélèvements positifs observés mais pourcentage non précisé. SCN : Staphylocoques à coagulase négative.
| Année | Particularité du prélèvement | Nombre de prélèvements | Technique d’analyse | % Prélèvements colonisés | Principales bactéries identifiées | Réf |
| Transabdominale | 39 % | |||||
| Biopsie à l’aide d’une brosse | 72 % | |||||
| 1983 | Biopsie à l’aide d’une brosse et lavage Liquide aspiré dans la lumière de la base de l’utérus | 18 | Culture | 72 % 100 % | Bacillus sp., S. epidermidis, lactobacilles, diphteroides | [16] |
| 1992 | Hystérectomie abdominale totale | 124 | Culture | 7% | S. epidermidis, Corynebacterium sp. | [15] |
| 1995 | Hystérectomie totale | 99 | Culture | 24 % | G. vaginalis, S. agalactiae | [17] |
| 2015 | Hystérectomie | 58 | PCR en temps réel* | 95 % | L. iners, Prevotella spp, L. crispatus, G. vaginalis | [20] |
| 2016 | Biopsie endométriale transcervicale | 19 | Métagénomique 16S Illumina MiSeq | 100 % | B. xylanisolvens, B. thetaiotamicron, B. fragilis | [18] |
| 2016 | Liquide utérin | 70 | Métagénomique 16S Pyroséquençage 454 | 100 % | Lactobacillus spp., Gardnerella | [19] |
| 1980 | Amniocentèse | 14 | Culture | 7% | SCN, streptocoques non hemolytiques | [23] |
| 1998 | Amniocentèse | 23 | Culture PCR | 0 % 0 % | [25] | |
| 2002 | Amniocentèse | 48 | PCR | 71 % | Streptococcus spp., F. nucleatum | [22] |
| 2008 | Amniocentèse | 775 15 | Culture Culture | 1 % + | U. urealyticum, SCN Propionibacterium, SCN | [24] |
| 2016 | Durant la césarienne | 15 | Métagénomique 16S Pyroséquençage 454 | 100 % | Enterobacter, Escherichia/Shigella, Propionibacterium | [26] |
| 2013 | Collecte dans les 12h suivant l’accouchement | 195 | Histochimie | 27 % | Bactéries non identifiées | [29] |
| 2014 | Issus de césarienne et voie basse | 24 | Métagénomique 16S Pyroséquençage 454 | + | Voie basse : Lactobacillus, Streptococcus, Prevotella Cesarienne : Microbacterium, Staphylococcus, Rhodococcus | [32] |
| Métagénomique glo- | ||||||
| bale | ||||||
| 2014 | Issus de césarienne et voie basse | 320 | 111 umina HiSeq Metagenomique 16S Pyrosequençage 454 | + | Proteobacteria, E. coli, Bacteroides spp., Actinobacteria | [31] |
| 15 | Culture | + | Propionibacterium, SCN | |||
| 2016 | Issus de césarienne | 15 | Métagénomique 16S Pyroséquençage 454 | 100 % | Enterobacter, Escherichia/Shigella, Propionibacterium | [26] |
| 2017 | Issus de césarienne et voie basse | 57 | Métagénomique 16S 111 umina MiSeq | + | Ralstonia insidiosa, Mesorhizobium spp. | [33] |
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