Rôle du microbiote dans la défense contre Clostridium difficile. A. Lorsque le microbiote est intact, certaines bactéries convertissent les sels biliaires primaires en sels biliaires secondaires s’opposant ainsi à la multiplication et à la colonisation par C. difficile. B. Lorsque le microbiote est perturbé suite à un traitement antibiotique, les sels biliaires primaires ne sont plus convertis en sels biliaires secondaires et ne peuvent plus exercer leur action inhibitrice sur C. difficile. C. Lorsque le microbiote est perturbé par un traitement antibiotique, la souche non pathogène C. difficile LEM1 apparaît et empêche la colonisation par la souche pathogène C. difficile VPI 10463.