Les deux catégories de mitophagie dans les cellules de mammifères. La dégradation des mitochondries par mitophagie s’effectue soit par ubiquitinylation de protéines mitochondriales externes, reconnues par des protéines adaptatrices, capables d’interagir avec la protéine LC3 (microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3) ancrée aux membranes du phagophore, soit directement par le biais de récepteurs localisés au niveau de la membrane externe de la mitochondrie, leur interaction avec la protéine LC3 assurant le recrutement de la mitochondrie au sein du phagophore.