Tableau I
Les rétrotransposons du génome humain. HERV : human endogenous retrovirus ; MaLR : mammalian apparent LTR retrotransposon ; LINE : long interspersed elements ; SINE : short interspersed elements ; SVA : SINE-VNTR (variable-number-of-tandem-repeats)-Alus ; séquences Alu : séquences de type SINE caractérisées par un site de reconnaissance unique pour l’enzyme de restriction AluI.
| Classification | Rétrotransposons avec LTR | Rétrotransposons sans LTR | ||
|---|---|---|---|---|
| Type | HERV | MaLR | LINE | SINE (Alu), SVA |
| Transcriptase inverse [15] | (+) | (-) | (+) | (-) |
| Taille (paires de bases) [4] | 9 000 | 3 000 | 6 000 | 300 |
| Nombre de copies dans le génome (x 1 000) [9] | 400 | 240 | 868 | 1 558 |
| Pourcentage du génome (%) [15] | 4,64 | 3,65 | ||
| 8 | 20,4 | 13,4 | ||
| Total (%) | 41,8 | |||
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