Figure 2.

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Comparaison de courbes de raréfaction de catalogues de gènes de référence provenant de quelques grands projets d’analyse de métagénomes. 1. Les séquences de 243 échantillons d’ADN métagénomiques (68 sites océaniques) ont été assemblées et soumises à une analyse de prédiction de gènes produisant un total de 111,5 millions (M) de gènes. Ces gènes prédits ont été regroupés avec les jeux de séquences de gènes d’autres métagénomes océaniques disponibles publiquement (26 millions de gènes « externes »). L’analyse de regroupement (clustering) de séquences identiques à 95 % a fourni un ensemble de gènes de référence de 40 millions de gènes de métagénomes océaniques. La partie droite de la courbe montre un très faible accroissement de diversité pour l’addition des 100 derniers échantillons. 2. La partie encadrée compare les courbes de raréfaction des gènes procaryotes marins (courbe noire, 24 millions de gènes) et intestinaux (courbe rouge, 7 millions de gènes) à partir d’échantillons normalisés pour la couverture en séquence. La nette différence du niveau des asymptotes fait ressortir une plus grande diversité de gènes de procaryotes marins (d’après [26]).
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