Tableau I.
Principales études d’intérêt du microbiote pulmonaire des pathologies respiratoires chroniques. BPCO : broncho-pneumopathie chronique obstructive ; CFTR : cystic fibrosis transmembrane conductance regulator ; VEMS : volume expiratoire maximum seconde ; GOLD : global initiative for chronic obstructive lung disease, sont des recommandations pour le diagnostic et la prise en charge des BPCO ; S-K score : le score de Shwachman-Kulczycki détermine la sévérité de la mucoviscidose.
| Pathologies | Patients | Principaux résultats | Année [Référence] |
|---|---|---|---|
| BPCO | Patients en exacerbation, comparaison en fonction de la prise en charge | Patients avec antibiothérapie : diminution des protéobactéries ; patients avec corticoïdes : augmentation des protéobactéries et d’autres phyllies | 2014 [24] |
| BPCO | BPCO et fumeurs non BPCO | Grande variété dans le microbiome avec principalement des bactéries des genres : Prevotella, Sphingomonas, Pseudomonas, Acinetobacter, Fusobacterium, Megasphaera, Veillonella, Staphylococcus et Streptococcus | 2013 [22] |
| BPCO | BPCO et individus sains : microbiote post-infection à rhinovirus | Augmentation du nombre de protéobactéries à J15 chez le sujet avec BPCO avec expansion d’un clone présent avant l’infection virale | 2013 [34] |
| BPCO | BPCO | 30 % de patients avec des bactéries pathogènes | 2008 [25] |
| BPCO et mucoviscidose | 8 non-fumeurs ; 8 fumeurs 8 BPCO GOLD4 ; 8 mucoviscidoses | Microbiome du patient mucoviscidosique plus abondant et moins divers ; moins d’acinétobactéries dans la mucoviscidose, plus de Firmicutes dans la BPCO | 2012 [33] |
| Mucoviscidose | Patients à différents stades de mucoviscidose | P. aeruginosa, H. influenzae, S. pneumoniae S. aureus sont des marqueurs du probable déclin du VEMS | 2014 [26] |
| Mucoviscidose | 23 patients | Stabilité du microbiote pendant les périodes d’exacerbation ; lien entre faible diversité et diminution de la fonction ventilatoire | 2012 [19] |
| Mucoviscidose | Patients avec mucoviscidose stable | Lien entre faible diversité et diminution de la fonction ventilatoire, le S-K score et l’indice de masse corporelle | 2012 [11] |
| Mucoviscidose | Enfants avec mucoviscidose suivis entre la naissance et 21 mois | Lien entre facteurs nutritionnels, microbiote digestif et évolution du microbiote pulmonaire du patient avec une mucoviscidose | 2012 [13] |
| Mucoviscidose | Mucoviscidose : prélèvements à 6 ans versus 8-9 ans | Évolution du microbiote avec l’âge : diminution de la diversité bactérienne avec prédominance de la famille des Pseudomonadaceae | 2012 [15] |
| Mucoviscidose | Mucoviscidose de l’enfant à l’adulte de 72 ans | Rôle de l’âge sur l’augmentation en richesse et la diminution de diversité du microbiome ; lien mutation CFTR et microbiome pulmonaire | 2010 [17] |
| Asthme | Patients avec asthme cortico-résistant, ou cortico-sensible et patients non asthmatiques | Plus d’acinétobactéries chez les asthmatiques cortico-résistants ; expansion de certaines protéobactéries chez certains asthmes cortico-résistants et cortico-sensibles | 2013 [23] |
| Asthme | Enfants asthmatiques versus enfants sains | Plus de protéobactéries chez les individus asthmatiques. Plus de Firmicutes et d’acinétobactéries chez les non asthmatiques | 2013 [27] |
| Asthme | Enfants asthmatiques versus enfants sains | Grande proportion de protéobactéries et staphylocoques alors que Bacteroides prédomine chez les enfants sains | 2010 [8] |
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