Capture de la conformation des chromosomes (3C) et ses dérivés. A. Génération des produits de ligation. Les cellules sont traitées au formaldéhyde de façon à fixer les interactions entre fragments de chromatine spatialement proches. Les noyaux sont isolés, et la chromatine est digérée par une enzyme de restriction avant ligation en conditions diluées, et purifiée. B.  Principaux variants du 3C. Pour la 3C, l’analyse des produits de ligation s’effectue par PCR classique ou, comme décrit plus récemment, par séquençage à haut débit après sonication et sélection de la taille des produits [24]. L’analyse des interactions entre une région d’intérêt (appât) et le reste du génome par la technique de la 4C se fait par PCR inverse en utilisant des amorces spécifiques de l’appât. Pour la 5C, la librairie produite par la 3C est analysée par une amplification impliquant la ligation (AML). Un très grand nombre d’amorces peuvent être utilisées simultanément. Pour la HiC, un résidu biotinylé est introduit avant ligation afin de purifier sélectivement les fragments. L’ensemble des produits est séquencé à haut débit. D’après [14].