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Figure 1.

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Présentation sommaire de la traduction canonique bactérienne. Démarrage : après appariement entre l’ARNm et le 30S via des séquences complémentaires d’ARN (interactions Shine-Dalgarno/anti-Shine-Dalgarno), le codon d’initiation AUG (voire GUG ou UUG) est positionné dans le site P. Un complexe initiateur, constitué de l’ARNt-fMet, d’IF2 et de GTP, s’y fixe, en présence des deux autres facteurs d’initiation, IF1 et IF3. La grande sous-unité ribosomique 50S se lie alors au complexe, provoquant l’hydrolyse du GTP et le départ des facteurs d’initiation. élongation : le facteur d’élongation EF-Tu amène les ARNt aminoacylés (aa-ARNt) au site A du ribosome sous la forme d’un complexe ternaire aa-ARNt-EF-Tu·GTP. S’il y a correspondance entre le codon de l’ARNm et l’anticodon de l’ARNt, EF-Tu hydrolyse le GTP et se dissocie, tandis que l’ARNt pénètre profondément dans le site A (étape d’accommodation). Le peptide naissant est transféré à l’ARNtaa accommodé dans le site A, entraînant l’allongement du peptide d’un acide aminé. Par un mouvement de cliquet spontané (ratchet) entre ses deux sous-unités, le ribosome oscille alors entre deux conformations. Le facteur d’élongation EFG- GTP se lie alors au ribosome, et l’hydrolyse du GTP permet la translocation des ARNt du site A au site P, et du site P au site E. S’ensuit le départ d’EF-G-GDP. Le processus est itératif, ce qui provoque l’allongement séquentiel du peptide naissant, tandis que les ARNt se déplacent ° travers les sites ribosomiques A, P et E. Terminaison : lorsqu’un codon de terminaison (ou codon stop UAA, UAG ou UGA) atteint le site A, un facteur de libération de classe I (RF1 ou RF2) se lie et catalyse la séparation entre la chaîne polypeptidique et l’ARNt en place dans le site P. La protéine néosynthétisée est libérée du ribosome, après prise en charge par des machines de repliement co-traductionnel (MRC). Un complexe binaire composé de RF3, un facteur de libération de classe II, et d’une molécule de GTP, facilite la dissociation de RF1 ou RF2 et de l’ARNt déacylé. Recyclage : le facteur de recyclage ribosomique (RRF) associé à EF-G recycle le ribosome en séparant les deux sous-unités, libérant les ARNt et l’ARNm. Un nouveau cycle de traduction peut alors démarrer. aa-ARNt : ARN de transfert aminoacylé ; ARNm : ARN messager ; fMet-ARNt : ARN de transfert N-formylméthionine ; EF-G : facteur d’élongation G ; GDP : guanosine diphosphate ; GTP : guanosine-5’-triphosphate ; EF-Tu : facteur d’élongation thermosensible ; IF : facteur d’initiation ; MRC : machine de repliement co-traductionnel ; RF : facteur de libération ; RRF : facteur de recyclage ribosomique ; SD : séquence de Shine-Dalgarno ; 30S : petite sous-unité ribosomique ; 50S : grande sous-unité ribosomique.

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