Effets opposés de l’élongation de la transcription sur l’épissage alternatif. A. Une élongation de la transcription rapide entraîne préférentiellement le recrutement de la machinerie d’épissage sur le site 3’ d’épissage fort de l’intron en aval et non sur le site 3’ d’épissage faible de l’intron en amont, induisant alors une exclusion de l’exon. Cependant, un ralentissement de l’élongation permet le recrutement du spliceosome au niveau du site 3’ faible, permettant alors l’inclusion de l’exon. B.  Lorsque les deux sites 3’ d’épissage sont de force similaire et que l’intron en amont possède une séquence inhibitrice de l’épissage (en rouge), une élongation rapide entraîne un recrutement du spliceosome sur chacun des sites, suivant le modèle de la définition de l’exon, et l’inclusion de l’exon. Une élongation lente permettra au facteur d’épissage de reconnaître sa séquence cible avant que la définition de l’exon ait lieu, c’est-à-dire avant que la machinerie d’épissage ne soit recrutée au site 5’ d’épissage entraînant une stabilisation du niveau du site 3’ ; l’exon sera donc exclu.