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Tableau I.

Nouvelles mutations identifiées par le séquençage haut débit d’échantillons de lymphomes T périphériques (PTCL). ND : non déterminé ; ATM : ataxia telangiectasia mutated ; B2M : beta 2-microglubulin ; SMARCAL1 : SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1 ; PRKD2 : protein kinase D2 ; CDKN2A : cyclin-dependent kinase inhibitor 2A ; CD58 : lymphocyte function-associated antigen 3 (LFA-3) ; RHOT2 : ras homolog gene family member T2.

Gène Mutation Conséquence prédite Fréquence (PTCL) Fonction protéique Remarques
RHOA C16R ND 25,0 % Petite GTPase : polarisation, migration, contrôle des éléments dynamiques du cytosquelette Récurrence de RHOA G17V Spécifique des PTCL de phénotype TFH (T follicular helper)
G17V Inactivation
G17E ND
G17del Inactivation
T19I ND
D120Y ND
A161E Inactivation

CD58 F43fs Inactivation 4,0 % Interaction entre cellules immunitaires Mutations permettant d’échapper à l’immunosurveillance antitumorale. Aussi observées dans des lymphomes de type B
K60fs Inactivation
S107X Inactivation
R152X Inactivation
G210C ND
G210S ND

FYN L174R Activation 3,0 % SRC kinase/signalisation intracellulaire en amont du TCR, induisant la prolifération et la différenciation T Mutations sensibles au dasatinib, inhibiteur des kinases SRC
R176C Activation
Y531H Activation

ATM T2333K ND 2,0 % Impliquée dans les mécanismes de réparation de l’ADN Gène supresseur de tumeur
D2959N ND
R3008H ND

TET3 G1360S ND 1,5 % Oxygénase dépendante du 2 OG et du Fe(II)/contrôle de la méthylation de l’ADN Apparentée à TET2
D1469fs Inactivation

CDKN2A E69X Inactivation 1,5 % Contrôle du cycle cellulaire Gène supresseur de tumeur
R80X Inactivation

PRKD2 R147W ND 1,5 % Signalisation intracellulaire en amont du TCR, induisant la prolifération et la différenciation T
V680M ND

RHOT2 p.442_splice ND 1,5 % Famille des RHO GTPases
R123Q ND

B2M M1R Inactivation 0,7 % Interaction entre cellules immunitaires Mutations permettant d’échapper à l’immunosurveillance antitumorale. Aussi observées dans des lymphomes de type B
E56X Inactivation

SMARCAL1 T417M ND 0,7 % Famille SWI/SNIF/remodelage de la chromatine

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