Modèle théorique de la biogenèse primaire des piARN et de l’amplification par cycle ping-pong. L’endonucléase Zucchini est responsable de la maturation de transcrits portant les clusters de piARN. Les pré-piARN sont reconnus par une protéine PIWI (ici PIWI A), qui a une préférence pour les séquences présentant un U en 1^re position. Associés à PIWI A, les pré-piARN doivent encore subir une maturation par une exonucléase 3’-5’, ainsi que par HEN1 qui apporte un groupement méthyl en 2’O de l’extrémité 3’ ce qui les rend fonctionnels. Les piARN primaires ainsi générés peuvent s’engager dans le cycle ping-pong. Par complémentarité de séquence, le piARN primaire dirige le clivage du rétrotransposon ciblé (brin sens ou antisens) par la protéine PIWI A qui porte l’activité endonucléase. La nouvelle extrémité 5’ générée est reconnue par une autre protéine PIWI (ici PIWI B), mais cette protéine peut être la même que la première. Il est à remarquer que l’extrémité 3’ du piARN secondaire est maturée et modifiée comme l’est le piARN primaire. Le piARN secondaire peut diriger l’activité de clivage de PIWI B sur le transcrit portant les clusters de piARN, générant ainsi un nouveau piARN secondaire dont la séquence est identique au piARN primaire, et ainsi de suite. Les piARN dont l’extrémité 5’ est générée par l’action de Zucchini sont appelés piARN primaires, alors que les piARN dont l’extrémité 5’ est générée par les protéines PIWI sont appelés piARN secondaires. Ainsi, les piARN notés A10 représentent des piARN secondaires, alors que les piARN notés U1 peuvent être primaires ou secondaires.