Mécanisme d’opération de la machine moléculaire. A. Présentation de l’anneau moléculaire, de l’axe portant les acide aminés (phénylalanine en vert, leucine en rose et alanine en rouge), du stoppeur et d’un atome de cuivre. B, C. Formation du rotaxane par active metal template. D. L’unité catalytique est fixée au macrocycle. E, F. L’assemblage moléculaire démarre : le bras enlève le premier acide aminé de l’axe et le transfère sur le site d’élongation du macrocycle. G, H. L’anneau est libre de se déplacer jusqu’au second acide aminé, la leucine, qui est, à son tour, détachée de l’axe et connectée à la phénylalanine. I. Le processus continue jusqu’à ce que tous les acides aminés aient été retirés de l’axe par la machine moléculaire. À ce stade, la synthèse est terminée et l’anneau peut se désenfiler de l’axe emportant avec lui le peptide nouvellement formé. Les images sont tirées d’une vidéo disponible à l’adresse suivante : http://www.catenane.net/pages/2013pep_synth_video.html.