Origine des organites à ­l’intérieur des cellules de Plasmodium. A. Endosymbiose primaire. Un seul événement d’endosymbiose  « primaire » s’est déroulé après qu’une cellule ancestrale primaire a ingéré une cyanobactérie. Il est important de noter qu’à la suite de cette première endosymbiose, les deux membranes délimitant le chloroplaste dérivent des deux membranes délimitant initialement la cyanobactérie. Cette association s’est maintenue au cours du temps, la cyanobactérie contribuant à la vie cellulaire en apportant entre autres la possibilité de réaliser la photosynthèse, mais aussi de synthétiser des acides gras, des vitamines, des isoprénoïdes, etc. Toutes les algues étudiées à ce jour, vertes, rouges ou glauques, sont issues de cet événement unique. B. Endosymbiose secondaire. À plusieurs moments de l’évolution, des événements de nature semblable ont eu lieu, mais avec des cellules plus complexes. Un de ces événements d’endosymbiose dite « secondaire » a conduit une algue rouge à se maintenir dans une cellule eucaryote secondaire. À la suite de cette deuxième endosymbiose, les membranes délimitant le chloroplaste comprennent en plus des membranes issues du phagosome et de la membrane plasmique de l’algue rouge. Au cours du temps, l’association s’est maintenue, les éléments « ­redondants » ou « inutiles » des deux cellules ont disparu, et il ne reste aujourd’hui que l’apicoplaste limité par quatre membranes.