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Tableau I.
Résumé des principales études utilisant le MALDI-TOF en routine pour l’identification bactérienne. GN : Gram- ; GP : Gram+ ; nd : non disponible ; Id : identification.
| Auteurs | Échantillons | Id à l’espèce | Id au genre | Identifications difficiles | Commentaires | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Seng et al., 2009 [13] | Routine (n = 1 660) | Tous les prélèvements de routine | 83,8 % | 95,0 % | Propionobacterium acnes | Dans cette étude, le MALDI-TOF est utilisé d’emblée pour l’identification. |
| Streptococcus pneumoniae | ||||||
| Stenotrophomonas maltophilia | ||||||
| Shigella sp. | ||||||
| Blondiaux et al., 2009 [15] | Routine (n =362) | Tous les prélèvements de routine | 72,9 % | 87,0 % | Streptococcus du groupe viridans | |
| Shigella sp. | ||||||
| van Veen et al., 2010 [14] | Routine (n =980) | Tous les prélèvements de routine | 92,0 % | 98,8 % | Streptococcus pneumoniae | |
| Bactéries anaérobies | ||||||
| Bizzini et al., 2010 [16] | Routine (n = 1 371) | Tous les prélèvements de routine | 93,2 % | 98,5 % | Shigella sp. | Une étape d’extraction permet d’augmenter le % de résultats valides de 22,9 % |
| Streptococcus sp. | Erreurs de taxonomie essentiellement. | |||||
| Gravet et al., 2010 [17] | Routine (n = 10 000) | Tous les prélèvements de routine | nd | 98,8 % | Corynebacterium sp. | Dans cette étude, le MALDI-TOF est utilisé d’emblée pour l’identification. |
| Streptococcus sp. | ||||||
| Bessède et al., 2010 [18] | Routine (n = 1 013) | Tous les prélèvements de routine | 97,3 % | 99,0 % | Acinetobacter sp. | Une étape d’extraction permet d’augmenter le % d’identification à l’espèce de 14,7 % |
| Streptococcus pneumoniae | Nombre insuffisant de souches dans la banque de données pour certaines espèces | |||||
| Prod’hom et al., 2010 [24] | Sang (n = 126) | Hémocultures positives | 77,8 % | 78,7 % | Streptococcus mitis group | La présence d’une capsule peut en partie expliquer le plus faible taux d’identification pour les bactéries :S. pneumoniae, H. influenzae, K. pneumoniae |
| GN : 89,1 % | GN : 89,1 % | Staphylococcus sp. | ||||
| GP : 71,6 % | GP : 72,9 % | |||||
| La Scola et al., 2009 [19] | Sang (n = 599) | Hémocultures positives | 76,0 % | 76,0 % | Streptococcus sp. | |
| Échantillons polymicrobiens | ||||||
| Stevenson et al., 2009 [20] | Sang (n = 212) | Hémocultures positives (179) | 80,2 % | 80,2 % | Streptococcus du groupe mitis | |
| Flacons ensemencés (33) | Propionobacterium acnes | |||||
| Ferroni et al., 2010 [21] | Sang (n= 685) | Hémocultures positives (388) | 89,0 % | 98,0 % | Streptococcus pneumoniae | En cas d’hémoculture polymicrobienne, le germe prédominant est dans la plupart des cas identifié |
| Flacons ensemencés (312) | Streptococcus du groupe mitis | Méthode très rapide | ||||
| Christner et al., 2010 [22] | Sang (n = 277) | Hémocultures positives | 94,2 % | 95,0 % | Cocci Gram+ | Les difficultés d’identification résultent d’un nombre insuffisant de bactéries, plus fréquent avec les Gram+ |
| Ferreira et al., 2010 [26] | Sang (n = 300) | Hémocultures positives | 42,6 % | 71,6 | Streptococcus mutans | Pas de culture polymicrobienne |
| GN : 83,3 % | GN : 96,6 % | Staphylococcus sp. | ||||
| GP : 31,8 % | GP : 65,7 % | Staphylococcus aureus | ||||
| Moussaoui et al., 2010 [25] | Sang (n = 532) | Hémocultures positives | 90,0 % | nd | Streptococcus groupe mitis | |
| GN : 91,1 % | Staphylococcus sp. | |||||
| GP : 89 % | ||||||
| Ferreira et al., 2010 [23] | Urine (n = 220) | Urines positives | 91,8 % | 92,7 % | Streptococcus sp. | Meilleurs résultats avec un inoculum> 105 CFU/ml |
| GN : 93,6 % | GN : | Enterococcus sp. | E. coli > 105 CFU/ml : 97,6 % | |||
| GP : 66,6 % | 94,6 % | Raoultella sp. | Identifications correctes | |||
| GP : | ||||||
| 66,6 % | ||||||
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