La biologie des systèmes et la prédiction d’interactions génétiques. A. Les modèles de réseau d’interaction ont permis de mettre en évidence que l’étude de la fluctuation du niveau d’expression de deux gènes dans des centaines de conditions expérimentales permet de prédire avec une bonne efficacité si ces deux gènes ont un lien fonctionnel [29]. Sont représentés dans cette figure les niveaux d’expression de deux gènes dans 58 conditions expérimentales différentes (colonnes). Cette figure a été conçue avec des données réelles provenant du transcriptome du nématode Caenorhabditis elegans. Deux gènes exprimant une fluctuation transcriptionnelle similaire dans un grand nombre de conditions expérimentales différentes ont une probabilité plus élevée d’être fonctionnellement liés que deux gènes ayant une très faible corrélation de leurs profils transcriptionnels. B. De même, deux gènes codant pour des protéines ayant la capacité d’interagir ont aussi une plus forte probabilité d’être enrôlés dans les mêmes mécanismes moléculaires que deux gènes codant pour des protéines n’ayant pas cette capacité [30]. Sont représentées dans cette figure les interactions protéines-protéines identifiées dans les interactomes de Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans et Homo sapiens pour 4 gènes très bien conservés entre ces organismes. Si les produits de deux gènes interagissent directement dans l’un de ces interactomes, la probabilité d’interaction fonctionnelle entre ces deux gènes est plus élevée que si aucune interaction n’a pu être détectée. Les propriétés prédictives de ces données biologiques sont cumulatives et permettent par leur association d’augmenter le niveau de certitude de la prédiction dans un réseau intégré [31].