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Relation entre la structure de la chromatine et la transcription du génome viral. A. La structure chromatinienne au niveau du génome viral. Deux nucléosomes, nuc0 et nuc1, sont positionnés de manière précise dans le LTR du provirus VIH-1. Le nucléosome nuc1, localisé au niveau du site d’initiation de la transcription, peut être remodelé/perturbé par l’activité de molécules modifiant la structure de la chromatine [19]. B. Les modifications épigénétiques et le contrôle de la transcription. La régulation de la transcription des gènes est influencée par l’état de compaction de la chromatine. Ainsi, l’hétérochromatine, qui correspond à de la chromatine compacte, va empêcher la transcription des gènes alors que l’euchromatine, la forme relâchée, va favoriser celle-ci. Le passage d’une forme de chromatine à l’autre est réalisé grâce aux modifications épigénétiques, représentant le code histone. Les modifications épigénétiques associées à un état transcriptionnellement inactif vont permettre le recrutement des protéines de l’hétérochromatine (HP1) qui vont alors structurer la chromatine en hétérochromatine.

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