Principe des puces à protéines exhaustives. La source protéique pour la fabrication de ces puces provient de tumeurs ou de cultures cellulaires. Les protéines sont fractionnées dans un premier temps par isofocalisation électrique liquide (20 fractions). Chacune des fractions est ensuite séparée en 92 autres fractions sur une colonne de chromatographie liquide en phase inverse. Au final, les 1 840 fractions sont déposées sur un support solide avant d’être hybridées, comme précédemment, avec des sérums issus de patients atteints de cancer et d’individus contrôles. Il est alors possible de revenir à la fraction d’origine afin de valider la réactivité d’un antigène par western blot et de l’identifier par spectrométrie de masse.