Appariement homologue des Xic et mise en place de l’inactivation. Dans les cellules ES indifférenciées, Xist est exprimé à un faible niveau à partir de ses deux allèles. L’ARN Xist (en vert) est alors visualisable par ARN FISH (hybridation in situ en fluorescence) sous la forme de deux points ponctuels. Au tout début de la différenciation, les deux locus Xpr (représentés en rouge) s’apparient transitoirement, permettant ainsi à la cellule de détecter la présence de ses deux chromosomes X (étape de sensing) [7]. Le gène Xist est alors activé, induisant un début d’accumulation biallélique de l’ARN en cis. Une fois Xist activé, une seconde phase d’appariement homologue des Xic permet de rendre son expression monoallélique (étapes de comptage/choix). Cette seconde phase d’appariement concerne non seulement la région Xpr mais également la région Tsix/Xite, impliquée dans la régulation négative de Xist [7, 10, 11]. Une fois initiée, l’inactivation est stable et maintenue au cours des divisions cellulaires.