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Figure 5.

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A. Complexe entre la protéine SmpB et le domaine pseudo-ARNt de l’ARNtm résolu par cristallographie aux rayons X. La protéine SmpB se lie à la partie coudée de la portion ARNt de l’ARNtm. L’une des deux faces basiques de la protéine (du côté de son extrémité amino-terminale) fait face à l’ARN tandis que l’autre (proche de l’extrémité carboxy-terminale) reste disponible pour interagir avec d’autres portions de l’ARNtm ou avec les ARN ribosomiques [18]. B. Localisation de l’une des deux protéines SmpB au sein de la petite sous-unité 30S d’un ribosome bloqué en cours de traduction par cryo-microscopie électronique. La protéine SmpB-2 est visualisée en rose dans le site de décodage. Les ARNt placés dans les sites P et E sont en vert et orange respectivement. La grande sous-unité a été volontairement omise par souci de clarté [13]. C. Vue tridimensionnelle d’un ribosome bloqué lié au complexe quaternaire ARNtm/2SmpB/EF-Tu•GTP obtenue par cryo-microscopie électronique. La densité du ribosome est représentée sous forme semi-transparente. Le complexe quaternaire est en rouge. SmpB1 interagit avec la grande sous-unité ribosomique ; SmpB-2 avec le centre de décodage de la petite sous-unité [15]. D. Modèle atomique du complexe représenté en C. Les protéines SmpB-1 et SmpB-2, respectivement colorées en gris et violet, sont placées de part et d’autre de la portion ARNt de l’ARNtm. La protéine EF-Tu (rouge) se situe dans la même position que lors de la traduction canonique tandis que les pseudo-nœuds forment un grand arc qui place le cadre ouvert de lecture de l’ARNtm à proximité du centre de décodage du ribosome [15] (Figures 5B et 5C et D reproduites avec la permission de The American society for biochemistry and molecular biology et The National Academy of Sciences, USA, respectivement).

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