Figure 4.

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Représentation schématique de la trans-traduction. ❶ La protéine SmpB (violet) se lie au site A vide de la petite sous-unité d’un ribosome bloqué. ❷ Après activation par la protéine ribosomique S1 (gris) l’ARNtm rejoint le ribosome bloqué sous forme d’un complexe ternaire avec EF-Tu/GTP (orange). Deux protéines SmpB font partie du complexe initial. Le mode d’arrivée de la seconde protéine SmpB est encore débattu : soit directement au ribosome, soit en complexe avec l’ARNtm. ❸ Après transpeptidation, le ribosome bloqué bascule sur la portion messager de l’ARNtm. L’ARNm tronqué est éliminé et dégradé par les ribonucléases cellulaires (RNase R chez E. coli). ❹ La traduction se poursuit jusqu’à atteindre le codon de terminaison de l’ARNtm, reconnu par les facteurs de terminaison (RFs). ❺ Le peptide tronqué est libéré, marqué par un signal de dégradation par les protéases cellulaires (rouge). Le ribosome est ensuite recyclé. Les couleurs attribuées à chaque composant du ribosome bloqué sont identiques à celles de la Figure 1.
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