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Figure 1.

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Principe de la puce à cellules pour la génomique fonctionnelle. Un mélange d’acides nucléiques, de polymère et d’agent de transfection est déposé avec un robot de microdépôts sur une lame de verre. Les ressources génomiques utilisées, idéalement des collections pangénomiques, peuvent être de l’ARN (siARN ou shARN, short hairpin RNA), ou de l’ADN (ADNc ou ORF, open reading frame, clonés dans des vecteurs d’expression). Une lame peut ainsi contenir plusieurs milliers de ces dépôts. Les cellules sont ensuite étalées sur les dépôts d’acide nucléique et l’agent de transfection permet la pénétration des acides nucléiques uniquement dans les cellules en contact direct avec le dépôt. Le phénotype des îlots de cellules transfectées peut être ensuite analysé. Les cellules transfectées avec un vecteur d’expression codant pour la GFP (green fluorescent protein) apparaissent en vert, à droite, sur la figure, alors que les cellules non transfectées sont visibles en gris.

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