Génome et épigénome. A. Vision traditionnelle opposant le génétique à l’épigénétique. Les mutations génétiques affectent la séquence nucléotidique de l’ADN. Les autres modifications, ou épimutations, sont dites épigénétiques. B. Vision nouvelle et graduelle allant du génétique aux différentes facettes de l’épigénétique. Les découvertes récentes concernant la dynamique des phénomènes épigénétiques suggèrent un référentiel commun aux mutations et aux épimutations : ce référentiel met en œuvre des échelles corrélées d’ordres chimique, spatial et temporel. À l’extrême gauche se trouve les mutations génétiques. À l’extrême droite se situent les états régulatoires de la cellule, par exemple un état de différenciation, implémentés par des composants distribués dans tout ou partie de la cellule. Entre ces deux extrêmes se trouvent les méthylations de l’ADN, le recrutement au niveau de l’ADN des histones ou de protéines histone-like, ainsi que leurs éventuelles modifications post-traductionnelles, et les réarrangements structuraux à longue portée du chromosome. Du génome à l’épigénome, les excursions à partir du chromosome sont de plus en plus lointaines (échelle spatiale), les temps caractéristiques pour qu’une (épi-)mutation se produise de plus en plus longs et, à l’inverse, le temps moyen pour que, à la suite d’(épi-)mutations, un changement phénotypique soit fixé est de plus en plus court.