Vue simplifiée des mécanismes moléculaires de l’horloge circadienne. Un hétérodimère CLK/BMAL1 est transloqué dans le noyau où il agit comme stimulateur de la transcription de gènes possédant des E-box. Les gènes Period (Per1-3), Cryptochromes (Cry1-2) et Rev-erbα (codant pour un membre de la famille des récepteurs nucléaires orphelins) possèdent des E-box dans leur promoteur. Les protéines PER et CRY s’hétérodimérisent, sont à leur tour transloquées dans le noyau et viennent réprimer l’activité transcriptionnelle du dimère CLK/BMAL1. La protéine REV-ERBα agit comme inhibiteur de la transcription de Bmal1. Les translocations nucléaires ainsi que la stabilité des dimères sont dépendantes de modifications post-traductionnelles, en particulier de phosphorylations par diverses kinases (notamment les caséine kinases (CK) Iδ et Iε). Le dimère CLK/BMAL1 stimule également la transcription de nombreux autres gènes possédant des E-box ; ces gènes sont dits contrôlés par l’horloge (gch) et assurent les sorties physiologiques de celle-ci. Par souci de simplification, les rôles (encore à préciser) des protéines RORalpha, DEC1-2, TIM, NPAS2 et BMAL2 dans l’horloge ont été omis (voir texte pour des précisions).