Structure des complexes PNA-ADN. Le PNA est une molécule synthétique dans laquelle le squelette sucre-phosphate de l’ADN a été remplacé par un squelette polyamide composé d’unités aminoéthylglycine sur lesquelles les nucléobases ont été attachées par une liaison méthyle carbonyle. L’hybridation du PNA aux acides nucléiques obéit aux règles classiques de l’appariement des bases : l’adénine est reconnue par la thymine et la guanine par la cytosine. Les liaisons hydrogène de type Watson-Crick sont impliquées dans la formation du duplex. Les bases pyrimidiques du PNA peuvent former des liaisons hydrogène de type Hoogsteen avec les bases puriques de l’ADN. Le PNA forme un complexe PNA-ADN-PNA avec le brin polypurique et induit le déplacement de l’autre brin de l’ADN. L’un des PNA du triplex forme des liaisons Watson-Crick (WC) avec l’ADN, l’autre des liaisons Hoogsteen (H).