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Figure 2.

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Identification des séquences ARN reconnues par une protéine cible. La technique du SELEX (systematic evolution of ligands by exponential enrichment) a été initialement développée avec une banque d’ARN synthétisée à partir d’oligonucléotides aléatoires (C). L’inconvénient de cette approche est d’isoler des cibles ARN non naturelles. Cette technique a été adaptée pour isoler directement des séquences naturelles. Le SELEX génomique (B) permet la construction d’une bibliothèque d’ARN cellulaire (transcription inverse avec des oligonucléotides de séquences aléatoires) alors que la technique de SERF (selection of random RNA fragment) (A) permet de transcrire des séquences d’ARN à partir de fragments d’ADN d’intérêt. Dans les trois cas (A, B, C), une fois la bibliothèque d’ARN synthétisée, la sélection peut se faire avec la protéine cible par les approches classiques (immunoprécipitation, retard sur gel, rétention des complexes sur filtres, etc.). Lorsque les ARN cibles auront été sélectionnés et identifiés, il restera à démontrer qu’ils ont une signification biologique.

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