Les systèmes de type IV chez les bactéries pathogènes. Les systèmes de sécrétion de type IV sont présents chez quelques bactéries pathogènes avec des comportements différents. Chez Agrobacterium et Helicobacter, la sécrétion de la molécule effectrice dans la cellule eucaryote receveuse nécessite un mécanisme dépendant du contact. Bordetella sécrète, dans le milieu extérieur, sa toxine (PT) par le système Ptl. Dans le cas des bactéries intracellulaires (Legionella, Rickettsia et Brucella), le système de sécrétion de type IV permet la survie de la bactérie dans la vacuole de phagocytose. La nature des protéines effectrices est encore inconnue chez ces bactéries, mais on peut supposer qu’elles interviennent sur le trafic intracellulaire de la vacuole d’endocytose, soit en modifiant la surface du phagosome, soit par interaction avec les cascades de signalisation des voies d’endocytose, pour diriger la bactérie vers une niche intracellulaire spécifique, favorable à sa survie.