La diversité du microbiote humain dans son contexte évolutif. Les différents panneaux sont des représentations multidimensionnelles de la composition des microbiotes. Chaque point représente un échantillon fécal pour lequel l’ADN est extrait, amplifié et séquencé (gène de l’ARN ribosomal 16S ou ADN total) afin d’inférer la composition en espèces bactériennes du microbiote. Les compositions sont ensuite comparées entre échantillons à l’aide d’une analyse de béta-diversité (indice de Jaccard). Sur les graphes, deux échantillons sont d’autant plus proches que les deux microbiotes qu’ils représentent partagent un grand nombre d’espèces bactériennes. (Sources des données 16S : panneau A [3,4], panneau B [5]. Silhouettes tirées de phylopic.org. Source des données métagénomiques : panneau C [6]. Code informatique et données pour reproduire le résultat disponible à https://github.com/FloMazel/Human_microbiome_evolution).