Mécanisme d’inactivation du chromosome X. A. L’inactivation du chromosome X est provoquée par l’accumulation de l’ARN XIST au niveau du futur chromosome X inactif (Xi) visualisée par hybridation in situ à l’aide de sondes spécifiques fluorescentes (image de gauche : ARN XIST en rouge, ADN du noyau marqué au DAPI en bleu ; échelle = 5 mm). L’ARN XIST permet le recrutement, via ses régions répétées A, B, C et E, et la concentration locale de nombreux facteurs protéiques (complexe ribonucléoprotéique XIST-RNP, décrit sur le panneau de droite). Les complexes XIST-RNP sont impliqués dans des étapes cruciales pour la mise en place et le maintien de l’inactivation du chromosome X : 1) localisation en cis des XIST-RNP le long du chromosome X ; 2) la répression transcriptionnelle des gènes du chromosome X ; 3) les changements conformationnels et chromatiniens aboutissant à l’hétérochromatinisation et à la formation du compartiment répressif du chromosome X inactif ; et 4) le maintien de l’état inactif au cours de la différenciation et des divisions cellulaires. Ces agrégations de complexes XIST-RNP jalonnent le territoire du chromosome X inactif (halo jaune) dans environ 50 sites distincts [28]. Les gènes qui échappent à l’inactivation du chromosome X sont délocalisés en dehors du territoire du chromosome X inactif et restent ainsi accessibles aux machineries transcriptionnelles. B. L’accumulation de XIST-RNP est associée à l’apposition de marques de chromatine répressives H3K27me3 et H2AK119ub, ici visualisées par immunofluorescence (respectivement en vert et en rouge) dans le même noyau (ADN du noyau marqué au DAPI en bleu ; échelle = 5 mm). C. Carte du chromosome X humain montrant les gènes soumis à l’inactivation et ceux y échappant spécifiquement dans chaque tissu ou de façon plus ubiquitaire (panneau de gauche ; adapté de [46]). Les gènes échappant à l’inactivation (exemple de KDM6A) montrent des couvertures inférieures en ARN XIST (RAP [RNA antisense purification]-seq) et des niveaux plus faibles de marques répressives d’histone (CUT&RUN [cleavage under targets and release using nuclease]) par rapport aux gènes sujets à inactivation (exemple de POLA1 [DNA polymerase alpha 1]) (panneau central, d’après [24]). Ces gènes sont transcrits à partir des deux chromosomes X comparés aux gènes soumis à l’inactivation, ici illustré par les images d’hybridation in situ sur ARN à droite (transcrits naissants de KDM6A ou POLA1 en vert, ARN XIST en rouge, ADN du noyau marqué au DAPI en bleu ; échelle = 5 μm).