Principe de l’évolution expérimentale. Une population de bactéries identiques génétiquement est cultivée au laboratoire pendant 28 jours (J0-J28) par repiquages successifs dans du milieu de culture neuf. Au cours de cette culture, des changements génétiques (e.g. mutations, mouvements de transposons, perte de plasmides) apparaissent de manière aléatoire dans certaines bactéries. Si ce changement est avantageux pour la bactérie, celle-ci va se multiplier plus vite que celles qui n’ont pas eu le changement, et progressivement devenir majoritaire dans la culture. À la fin de l’expérience, le changement pourra être caractérisé en séquençant le génome de la population bactérienne ou d’un certain nombre de bactéries issues de la culture finale ou d’échantillons intermédiaires. Pour éliminer tout changement génétique qui aurait pu survenir de manière aléatoire, seuls les changements identifiés lors de plusieurs expériences indépendantes sont considérés comme significatifs.