Approche de biologie systémique. 1. Vaccination : des échantillons biologiques sont prélevés chez des volontaires vaccinés au cours d’études cliniques. 2. Analyse des systèmes biologiques : l’immunogénicité et l’inocuité du vaccin peuvent être évaluées grâce à ces échantillons, le dosage de différents paramètres immunologiques avant et après vaccination : les anticorps, les cytokines, les métabolites, les protéines, les lipides, les transcrits, les cellules et le microbiote. Toutes ces mesures quantitatives mais aussi qualitatives sont générées grâce à des approches expérimentales et des technologies à haut-débit. 3. Interprétation des systèmes biologiques : ces données sont intégrées les unes aux autres grâce à des outils statistiques et bio-informatiques puissants. Des représentations graphiques alors générées permettent de visualiser et interpréter ces données en se basant sur des logiciels d’enrichissement fonctionnel, combinant les connaissances tirées de la littérature et la mesure de l’expression de gènes. Cela donne la possibilité de (a) générer de nouvelles hypothèses, (b) modéliser et (c) identifier des biomarqueurs d’efficacité vaccinale.