Orchestration de la physiologie rythmique du foie mise en évidence par protéomique nucléaire quantitative. La combinaison de l’analyse quantitative et temporelle du protéome et du phosphoprotéome nucléaire in vivo a permis de mettre en évidence la rythmicité de nombreux processus cellulaires fondamentaux tels que la régulation transcriptionnelle, l’assemblage des ribosomes et la réparation de l’ADN. Les cycles cellulaire et diurne (imagés en noir et blanc) semblent alignés et la polyploïdie rythmique que nous observons serait une conséquence de ce lien. La quantification de l’intensité relative des différents isotopes est symbolisée en haut à droite (m/Z représente le rapport de la masse [m] sur la charge [Z]). À la suite de la quantification du protéome en fonction du temps, sa rythmicité est ensuite évaluée (symbolisée par la carte thermique). Les gènes codants les protéines de l’horloge moléculaire quantifiées dans [9] sont indiqués. Cry’s : cryptochrome1 et cryptochrome2 ; Pers’s : period1 et period2 ; Clock : circadian locomotor output cycles kaput ; Bmal1 : brain and muscle aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein-1 ; Rev-erbs : Rev-erb-α ou Nr1d1 : nuclear receptor subfamily 1, group D, member 1 ; Rev-erb-β ou Nr1d2 : nuclear receptor subfamily 1, group D, member 2) ; RORα/γ : RAR-related orphan receptor alpha/ gamma. Les protéines du contrôle du cycle cellulaire sont les kinases WEE1 et polo-kinase -2 (PLK2) et les kinases dépendantes des cyclines ou CDK1, 4, 6. ZT : zeitgeber time ou temps donné.