Schématisation de la protéine SETD2 (SET domain containing 2) et de ses fonctions. (A) Les mutations répertoriées dans COSMIC (catalogue of somatic mutations in cancer) et cBioPortal, deux bases de données listant les mutations génétiques dans les cancers, ou identifiées dans notre étude sur 15 LTIME [4], sont indiquées et positionnées sur le schéma de la protéine SETD2. (B) Fonctions de SETD2 dans le remodelage des nucléosomes et l’organisation des microtubules du fuseau mitotique. (C) Illustration de l’histopathologie d’un cas de lymphome T intestinal monomorphe épithéliotrope (LTIME). La coloration à l’HE (hématoxyline-éosine) indique que la tumeur est constituée de nappes monotones de lymphocytes de taille moyenne, en l’absence de composante inflammatoire significative. SETD2 (3p21)/3p25 : hybridation in situ fluorescente (FISH) illustrant une délétion hétérozygote de SETD2 ; dans la majorité des noyaux on visualise un seul signal rouge, correspondant au locus de SETD2 en 3p21, contre deux signaux verts, représentant la région de contrôle conservée en 3p25. Di- et triméthylation de l’histone H3 (H3K36me2 et me3) : analyse immunohistochimique témoignant d’une perte de fonction de l’enzyme SETD2 (en sus de la délétion détectée par FISH, le séquençage a révélé la présence d’une mutation inactivatrice sur l’autre allèle) ; expression conservée de la forme diméthylée (me2) de la lysine 36 de l’histone H3, alors que la forme triméthylée (me3) est complètement absente dans les cellules tumorales (en présence de contrôles internes positifs : une petite structure vasculaire et quelques cellules réactives et stromales). AWS : associated with SET ; SRI : Set2 Rpb1 interacting ; Pol II : ARN polymérase II.