Schéma synthétique des fonctions des ATG dans les défenses de la cellule hôte infectée. Les ATG (autophagy related gene) peuvent avoir des fonctions de dégradation en participant à l’autophagie sélective des micro-organismes intracellulaires (xénophagie) et à la LAP (phagocytose associée à LC3 [microtubule-associated protein 1A/1B-light chain 3]). Ces fonctions permettent d’éliminer le micro-organisme et de présenter des antigènes via le complexe majeur d’histocompatibilité (CMH) de classe II. Lors de l’infection, d’autres substrats peuvent être sélectivement dégradés afin de moduler l’inflammation et maintenir l’homéostasie cellulaire. Par ailleurs, il existe d’autres fonctions des ATG qui sont impliquées dans le recrutement membranaire d’effecteurs de l’IFN (interféron)-II, importants pour limiter l’infection de certains virus et parasites. D’autres sont impliquées dans la réduction de l’inflammation. Enfin, en fusionnant avec les endosomes, l’autophagosome, ayant capturé un ARN simple brin, permet l’activation de certains TLR (Toll-like receptors). CARD9 : caspase recruitment domain-containing protein 9 ; NOD1/2 : nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1/2 ; PAMP : pathogen-associated molecular pattern ; ULK-1 : Unc-51-like kinase 1 ; UVRAG : UV radiation resistance-associated gene protein.