Conséquences de l’inhibition de l’autophagie dans l’épithélium intestinal. Un blocage de l’autophagie entraîne de nombreuses perturbations de l’homéostasie intestinale. Dans l’épithélium, on retrouve notamment des défauts dans les cellules caliciformes et les cellules de Paneth conduisant à une altération de la couche de mucus, un défaut de sécrétion de peptides antimicrobiens et une augmentation de la perméabilité de la barrière épithéliale. Associées à ces anomalies, on observe une translocation bactérienne à travers l’épithélium et une altération de la composition de la flore. Des défauts d’autophagie affectent également la fonction des cellules immunitaires avec plusieurs conséquences pro-inflammatoires.